14 марта 1966 года при заводском комитете Белоярской атомной электростанции была создана спортивная школа. Тогда и был принят первый тренер-преподаватель школы – Худорожкова Лилия Дорофеевна. В первые годы в школы работали отделения по баскетболу и гимнастике.

Базировалась школа в спортивном зале д/к  “Ровесник”. С вводом спорткомплекса в 1968 школа переезжает в новое здание “Электрона”. В то же время появляются новые виды спорта: конькобежный спорт, лыжные гонки, футбол. Тренерами-преподавателями работали Вагин В.И.,
Шипицин А.Н.(коньки), Голяков В.А.(лыжные гонки). С вводом в строй  плавательного бассейна “Нептун” в 1982 году в школе открывается отделение плавания.

С 1975 по 1986 год школу возглавляет директор Вагин Виктор Иванович,  1986-88 год – Крохалев  Андрей.  В самое сложное время с 1989 по 1993 год школа работала без директора.

До 1993 года деятельность школы неразрывно связана  коллективом БАЭС. Ученики школы выступают за спортивное общество “Труд”, а после его реорганизации за спортивное общество Профсоюзов.

В ноябре 1993 года Детско-юношеская спортивная школа профкома Белоярской АЭС постановлением  главы администрации г. Заречного №583 от 29.11.93 года передана в ведение Департамента образования администрации  г. Заречного.

 В 1999 году Постановлением Главы муниципального образования "Город Заречный" № 209-П от 01.04.1999 года было принято решение создать Заречное муниципальное образовательное учреждение дополнительного образования "Детско-юношеская спортивная школа" в порядке реорганизации Управления образования путем выделения. Учредителем Школы является городской округ Заречный. Функции и полномочия Учредителя осуществляет администрация городского округа Заречный. Отдельные функции в области кадрового, информационного, организационно-содержательного, методического, материально-технического, финансово-экономического обеспечения деятельности Школы осуществляет муниципальное казенное учреждение "Управление образования городского округа Заречный".